Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms