Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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