Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vmn1r67G5E8C1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms