Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r167G3UW71 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms