Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Gm3443F7CCV5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Gm3443F7CCV5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Gm3443F7CCV5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm3443F7CCV5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3443F7CCV5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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