Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm10378F6XQQ1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm10378F6XQQ1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm10378F6XQQ1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm10378F6XQQ1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm10378F6XQQ1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm10378F6XQQ1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gm10378F6XQQ1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gm10378F6XQQ1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gm10378F6XQQ1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gm10378F6XQQ1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gm10378F6XQQ1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm10378F6XQQ1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm10378F6XQQ1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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