Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms