Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms