Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm5415E9PXF3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms