Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms