Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms