Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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