Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ssxb8B1AY40 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ssxb8B1AY40 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ssxb8B1AY40 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ssxb8B1AY40 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ssxb8B1AY40 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ssxb8B1AY40 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ssxb8B1AY40 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssxb8B1AY40 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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