Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms