Protein–RNA interactions for Protein: A2ARP9

Catsper2, Cation channel sperm-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper2A2ARP9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsper2A2ARP9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms