Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms