Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm4T1NXB5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms