Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Top3bQ9Z321 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Top3bQ9Z321 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Top3bQ9Z321 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Top3bQ9Z321 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Top3bQ9Z321 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Top3bQ9Z321 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Top3bQ9Z321 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Top3bQ9Z321 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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