Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms