Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Tlr5Q9JLF7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tlr5Q9JLF7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Tlr5Q9JLF7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Tlr5Q9JLF7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tlr5Q9JLF7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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