Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ap4m1Q9JKC7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ap4m1Q9JKC7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms