Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tmod3Q9JHJ0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod3Q9JHJ0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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