Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trim39Q9ESN2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trim39Q9ESN2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trim39Q9ESN2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trim39Q9ESN2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trim39Q9ESN2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trim39Q9ESN2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim39Q9ESN2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim39Q9ESN2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim39Q9ESN2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim39Q9ESN2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim39Q9ESN2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms