Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms