Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms