Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms