Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms