Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm5Q9D7I9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms