Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms