Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms