Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2lQ9D478 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms