Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms