Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms