Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PompQ9CQT5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms