Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rrbp1Q99PL5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms