Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms