Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ciao1Q99KN2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ciao1Q99KN2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ciao1Q99KN2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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