Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms