Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PdgfdQ925I7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PdgfdQ925I7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PdgfdQ925I7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PdgfdQ925I7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PdgfdQ925I7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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PdgfdQ925I7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PdgfdQ925I7 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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PdgfdQ925I7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms