Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms