Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms