Protein–RNA interactions for Protein: Q91WJ8

Fubp1, Far upstream element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp1Q91WJ8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fubp1Q91WJ8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms