Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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