Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms