Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms