Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Atg16l1Q8C0J2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Atg16l1Q8C0J2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Atg16l1Q8C0J2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Atg16l1Q8C0J2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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