Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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