Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms