Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms