Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q8BP99 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q8BP99 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q8BP99 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q8BP99 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q8BP99 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q8BP99 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Q8BP99 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q8BP99 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q8BP99 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q8BP99 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q8BP99 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q8BP99 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q8BP99 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q8BP99 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q8BP99 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q8BP99 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q8BP99 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Q8BP99 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q8BP99 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q8BP99 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Q8BP99 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q8BP99 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Q8BP99 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Q8BP99 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q8BP99 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Q8BP99 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BP99 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BP99 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BP99 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BP99 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Q8BP99 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BP99 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BP99 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Q8BP99 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BP99 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BP99 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BP99 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BP99 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BP99 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Q8BP99 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Q8BP99 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Q8BP99 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BP99 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Q8BP99 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Q8BP99 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Q8BP99 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BP99 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Q8BP99 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BP99 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BP99 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BP99 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BP99 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BP99 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Q8BP99 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BP99 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BP99 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BP99 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BP99 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BP99 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BP99 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BP99 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BP99 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BP99 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BP99 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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